Berdasarkan cerita para orang tua atau tokoh masyarakat dahulu bahwa awalnya desa pulau alalak ini merupakan bagian dari desa pulau alalak, namun seiring dengan makin bertambahnya jumlah penduduk dan adanya aspirasi masyarakat yang menginginkan pemerataan pembangunan maka pada tanggal 20 bulan Agustus tahun 1964 desa pulau alalak di mekarkan jadi 3 buah desa yaitu, desa pulau alalak, desa pulau sewangi dan desa pulau sugara. Beberapa kali mengalami pergantian kepemimpinan.

Pertama kali di Bulan Agustus 1964 dipimpin oleh bapak H.muhammad amin, setelah itu berubah kepemimpinan di desa dipimpin oleh Bapak Darman sampai dengan 1969. Setelah beberapa tahun kepemimpinan berubah kepemimpinan di desa pulau alalak oleh Bapak Muhammad Jarni sampai tahun 1975. Pada tahun 1975 akhir sampai tahun 2002 desa pulau alalak dipimpin oleh salah satu warga desa yang dipilih oleh masyarakat desa pulau alalak yaitu bapak H.Abdul Gafar sebagai kepala desa definitif pulau alalak.

Pada pertengahan tahun 2022 dilaksanakan kepala desa secara langsung yang diikuti oleh lima orang kandidat calon kepala desa dan akhirnya terpilihlah seorang kepala desa pulau alalak yang bernama bapak hidayat ma’arif dengan masa bakti 2002 s/d 2014. Setelah masa jabatan bapak hidayat ma’arif berakhir desa pulau alalak dipimpin sementara oleh sekretaris desa bapak ishak KA selama kurang lebih 6 (enam) bulan.

Selanjutnya setelah berjalannya masa kepimpinan bapak ishak KA, maka pada tahun 2015 dilaksanakan pemilihan kepala desa secara langsung yang diikuti oleh 2 (Dua) orang kandidat calon kepala desa, dan akhirnya terpilihlah seorang kepala desa pulau alalak yang bernama Ahmad Yani dengan masa bakti 2015 s/d 2021. Selanjutnya setelah berjalannya masa kepimpinan bapak Ahmad Yani berakhir, maka pada bulan april Tahun 2022 desa pulau alalak dipimpin sementara oleh sekretaris desa bapak Mansyur, S.Ag sebagai Plh.Kepala Desa. Pada bulan Juni Tahun 2022 dilaksanakan pemilihan kepala desa secara langsung yang diikuti oleh 4 (empat) orang kandidat calon kepala desa, dan akhirnya terpilihlah seorang kepala desa pulau alalak yang bernama Ahmad Yani dengan masa bakti 2021 s/d 2027.